自2004年年初以来，截至2012年12月11日，货币基金近9年累计收益24.67%，年化收益2.48%，低于同期CPI年化2.81%水平约33BP。一方面因2004年、2007年、2008年、2010年、2011年CPI水平过高，负利率的态势较为严重，对货币基金收益有所打折；另一方面，主要因2011年11月之前货币基金所配置的协议存款属于定期存款的范畴，基于流动性的考虑，对货币基金收益有所稀释。从长期来看，货币基金年化收益与一年定期存款时间加权年化水平不相上下，稍低于后者约2BP，但在流动性上，货币基金基于申购赎回的便利性，性价比更高。

与同期利率市场化程度较高的货币市场工具相比，货币基金收益率稍甚一筹，高于同期7天回购年化利率2.22%约 26BP，高于7天SHIBOR约20BP，不过收益率走势与两者呈现较强的正相关关系，主要因货币基金主投利率市场化程度较高的货币工具。

从个基来看，货币基金收益率呈现出较强的规模盈利效应，主要基于规模较大的货币基金其规模与业绩通常能够实现较好的良性循环，在议价能力、流动性等风险控制方面占优；而规模较小的货币基金为应付赎回，一方面现金持有比例要高于规模较大的基金，对收益率有一定的稀释，另一方面为保持较高的流动性，投资券种期限或组合久期相对较短，而这些券种往往收益率更高，因此获取超额收益能力也较逊。具体来看，近6年规模排名前10的货币基金平均收益率均高于同期其他剩余的货币基金，尤其是在通胀位居高位的2008年和2011年，利差分别高达30BP、47BP。

此外，货币基金份额收益也有所差异，主要基于不同份额收取相应的费率不同所致。具体来看，货币基金在最早设立的两年间，只有A份额可供投资者选择，最低申购份额是1000份（1000元），主要针对市场上小额、散户投资者，随着市场的快速扩容及大额投资者介入，B份额逐渐进入市场，最低申购份额一般为500万份（500万元）或1000万份，主要针对机构大额投资者；在销售服务费上，货币基金A要略高于货币基金B（一般的A份额是0.25%，B份额是0.01%）。

因机构投资者资金实力雄厚及货币基金规模盈利效应的驱动，B份额收取销售服务费率较低，最终的收益也相对较高。从2006年至今，B份额收益均高于同期A份额收益，平均高出约15BP，但总体来说因其投资标的相同，收益差距并不大。